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一种快速分析CRISPR/Cas9基因编辑载体构建情况的方法及应用

申请人:湖北伯远合成生物科技有限公司 申请日期:2021-08-12 文献日:2021-10-22 等级:0 文献号:CN113528633A 当前状态:公开 类型:发明公开 主分类号:C12Q1/6869 分类号:C12Q1/6869 申请编号:CN202110924679.3 省份:湖北省 城市:湖北省黄冈市 申请人地址:湖北省黄冈市黄州区新港北路19号黄冈光谷联合科技城C9幢1-2层101-104号 申请人地址:湖北省黄冈市黄州区新港北路19号黄冈光谷联合科技城C9幢1-2层101-104号 发明者:吴磊

总结

本发明公开了一种快速分析CRISPR/Cas9基因编辑载体构建情况的方法,包括如下步骤:S1、基于靶标区间设计载体通用引物,扩增,构建文库,送高通量测序,得到测序数据;S2、对步骤S1中得到的测序数据进行质控;S3、对步骤S2中得到的质控后的数据进行两端reads的拼接,获得长序列数据;S4、根据靶标区间前后的载体序列是已知、并且相同的特点,对步骤S3中获得的长序列数据进行分析,然后将靶标区间序列提取出来,进行统计分析,从而可以获得靶标的构建情况;该方法快速精准、成本低廉,可以多样品混合测序,鉴定成千上万个基因编辑载体,只需要1G的数据量即可以满足分析需求,因此,在植物、动物或微生物载体构建中的应用领域具有良好的应用前景。

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