本发明公开了锦绣杜鹃EST‑SSR标记开发及应用，属于生物技术领域。该引物是基于锦绣杜鹃花转录组开发得到，在RNA‑seq的基础上，对大量转录组测序数据进行筛选，获取富含SSR位点的序列并进行SSR标记的引物设计，克服了目前锦绣杜鹃SSR分子标记数量少、开发效率低的障碍。利用3个近缘种检测引物的通用性和有效性，为锦绣杜鹃及其他杜鹃花科植物的遗传多样性分析研究、遗传连锁图谱构、花性状关键基因定位、分子标记辅助育种等研究奠定了基础。