本发明公开了一种用于鉴定黄州萝卜的SSR标记及方法，属于植物分子生物学领域。本发明的SSR标记的序列如SEQ ID NO.1所示，扩增该SSR标记的引物的序列如SEQ ID NO.2‑3所示。本发明方法包括如下步骤：提取待检样品的DNA，使用序列如SEQ ID NO.2‑3所示的引物进行PCR扩增，若扩增出227bp的特异条带，则判断所鉴定样品是黄州萝卜。本发明首次开发出适用于黄州萝卜特征与纯度检测的SSR分子标记，大大提高了鉴定黄州萝卜的速度和准确性。