本发明公开了NtCCoAOMT基因在提高烟草产绿原酸中的应用，属于植物基因工程领域。本发明通过研究发现NtCCoAOMT蛋白或其编码基因具有提高烟草产绿原酸中的应用，所述NtCCoAOMT蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示，其编码基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。将NtCCoAOMT蛋白的编码基因序列构建到植物表达载体中获得能表达NtCCoAOMT蛋白的重组载体，将构建的重组载体转入烟草中使NtCCoAOMT过表达，达到提高烟草产绿原酸的目的。本发明发现了NtCCoAOMT在烟草中过表达能极大幅度地提高绿原酸的产量，为绿原酸的生产提供了新的途径。